Allegro biedt een interne toepassing voor bestandsbeheer.
U kan nieuwe bestanden importeren, ze van de ene map naar de andere verplaatsen, een bestaand bestand openen.
Dankzij deze structuur van bestandsbeheer kan u ook bestanden beheren die gekoppeld zijn aan een of andere toepassing:
Facturen (aankoop/verkoop), DV, Financieel, ... of elk ander document gekoppeld aan eender welke fiche (algemeen, klanten, leveranciers, ...).